株式会社AQUAの直営店舗は、31店舗（9都県 14施設）ございます。
「店舗は施設の最後の展示」をコンセプトに、施設と店舗は別空間ではなく、ともに在る、驚きと感動と笑顔があふれるお店作りに努めております。
福岡市動植物園
Gift Shop Petit Monde
Café Rassembler
よこはま動物園 ズーラシア
上越私立水族博物館 うみがたり
Museum Shop Regalo
Restorante Los Cuentos del Mar
アクアパーク品川
北ZooShop
南ZooShop
AQUA SHOP LUCE
豊橋総合動植物公園
Museum Shop Rupes
のんほいパーク 中央売店
のんほいパーク 東売店
八景島シーパラダイス
BIG WAVE八景島
バナナムーン
ラハイナクルーズ
シーパラダイス食品館
アクアブルー
ブリーズ
デルフィス八景島
FRESH LOOSE
ファンタジーショップ
ののはなギフトショップ
Gift Shop Navis
こども動物自然公園 中央売店
ののはなカフェ
アクアテラス ギフトショップ
ひだまりカフェ
北ZooShop
なかよしショップ
デルフィス江ノ島
和（なごみ）
しゅうなんZOO-SHOP
わくわくキッチン
オージーヒル ギフトショップ
南ZooShop
